Il protagonista è Ark, un ragazzo che vive nel villaggio di Crysta, situato nel Darkside, la parte interna di una Terra immaginata come una sfera cava.

Un giorno Ark apre una porta proibita e trova il Vaso di Pandora. L'apertura del vaso provoca una catastrofe e gli abitanti del villaggio vengono congelati. Da quel momento Ark deve partire per un viaggio che, inizialmente, sembra essere semplicemente quello di far rinascere il mondo.

Se ti piacciono storie alla Secret of Mana/Zelda ma con una trama molto più ambiziosa e malinconica, Terranigma è proprio quel tipo di gioco.